Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga8A2ARA8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga8A2ARA8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga8A2ARA8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga8A2ARA8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga8A2ARA8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga8A2ARA8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga8A2ARA8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms