Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtf1A2AQ19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms