Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramel3A2AHA7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramel3A2AHA7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms