Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhbdl2A2AGA4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms