Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd4A2AFR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd4A2AFR3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms