Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2dnl1A2AFH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2dnl1A2AFH1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms