Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cyb561d1A2AE42 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyb561d1A2AE42 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cyb561d1A2AE42 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cyb561d1A2AE42 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cyb561d1A2AE42 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms