Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C87977A2A958 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C87977A2A958 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C87977A2A958 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms