Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prdm2A2A7B5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm2A2A7B5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms