Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pabpc1lA2A5N3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc1lA2A5N3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc1lA2A5N3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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