Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt24A1L317 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt24A1L317 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt24A1L317 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms