Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc112A0AUP1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc112A0AUP1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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