Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms