Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LII9

Gm45015, Predicted gene 45015, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45015A0A140LII9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm45015A0A140LII9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm45015A0A140LII9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms