Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Speer3W4VSP1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Speer3W4VSP1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms