Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc166S4R181 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc166S4R181 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms