Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsc22d3Q9Z2S7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms