Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp5Q9Z2P8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms