Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gipc2Q9Z2H7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gipc2Q9Z2H7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms