Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms