Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp1Q9Z273 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms