Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccne2Q9Z238 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne2Q9Z238 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne2Q9Z238 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms