Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap3b1Q9Z1T1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ap3b1Q9Z1T1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms