Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cacna2d3Q9Z1L5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms