Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Xpr1Q9Z0U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Xpr1Q9Z0U0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms