Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn15Q9Z0S5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn15Q9Z0S5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn15Q9Z0S5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn15Q9Z0S5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn15Q9Z0S5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms