Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp46a1Q9WVK8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp46a1Q9WVK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms