Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stxbp4Q9WV89 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stxbp4Q9WV89 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms