Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ArcQ9WV31 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArcQ9WV31 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms