Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn5Q9WU28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms