Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkraQ9WTX2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms