Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1Q9R1Q9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1Q9R1Q9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms