Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma1Q9R1P4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma1Q9R1P4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms