Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slit2Q9R1B9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slit2Q9R1B9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms