Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trex2Q9R1A9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms