Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntn3Q9R1A3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms