Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed2Q9R0Q3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Tmed2Q9R0Q3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed2Q9R0Q3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms