Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Wdr54Q9R0D8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Wdr54Q9R0D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Wdr54Q9R0D8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms