Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsjQ9R014 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsjQ9R014 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms