Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Npas3Q9QZQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms