Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps29Q9QZ88 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps29Q9QZ88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms