Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn8Q9QZ49 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms