Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hacd1Q9QY80 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms