Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb1Q9QXJ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms