Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc5Q9QX29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms