Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chaf1aQ9QWF0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chaf1aQ9QWF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms