Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma6Q9QUM9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma6Q9QUM9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms