Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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