Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhoaQ9QUI0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhoaQ9QUI0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms