Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc2lQ9JME7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc2lQ9JME7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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